Dalam rangka pencegahan wabah covid 19, Balai Karantina Pertanian Kelas I Kupang, melakukan kegiatan diantaranya adalah:
1. Melengkapi petugas karantina dengan APD (alat pelindung diri);
2. Menyediakan tepat cuci tangan, hand sanitaizer, masker dan sarung tangan disetiap area pelayanan karantina;
3. Memasang himbauan untuk selalu memakai masker, cuci tangan dan jaga jarak;
4. Menyediakan vitamin untuk daya tahan tubuh pegawai;
5. Memberikan bantuan sembako bagi ASN golongan 5 ke bawah, PPNPN dan masyarakat;
6. Ikut menjadi tim terpadu penanggulangan covid 19 di propinsi NTT.